对于卵巢功能正常和无法解释的不孕症的年轻夫妇，可以尝试一个三步骤的过程。第一步是改善你的生活方式，达到合理的体重并减少压力。没有证据表明体外受精以外的任何治疗方案对不明原因的不孕不育是有效的。
诱导排卵：对于年轻、卵巢储备正常、不孕时间<2年且有卵泡发育不良或黄体功能不全的夫妇，可以尝试诱导排卵治疗。推荐的药物和方案是来曲唑或来曲唑+低剂量促性腺激素，持续3-6个周期，旨在实现单卵泡发育。
促排卵加宫腔内人工授精：对于卵巢功能正常且<2年不孕的年轻夫妇，建议采用3-6个周期的促排卵加宫腔内人工授精（IUI）。诱导排卵的药物和方案是来曲唑或来曲唑+低剂量促性腺激素。单纯的人工授精并不能提高不明原因的不孕夫妇的怀孕率，而联合使用促排卵治疗可能会增加怀孕的机会。数据显示，三个周期的累积怀孕率可以达到35%左右，比单纯的人工授精或单纯的促排卵要高。
体外受精和胚胎移植：如果促排卵和IUI治疗超过3-6个周期没有成功，这意味着怀孕的希望已经不大。因此，应考虑体外受精（IVF）。在不明原因的不孕症中，每个试管婴儿周期的怀孕率约为35%至40%。
此外，试管婴儿可以诊断一些原因不明的不孕症，如卵细胞成熟缺陷、受精障碍和胚胎发育障碍。15-30%的不明原因的不孕症患者可能很少或没有受精，原发性不明原因不孕症的夫妇有11-22%的完全受精失败的风险。在随后的周期中改用单一卵胞浆内单精子注射（ICSI）可能会使该患者群体的怀孕率提高。